
蛋白质数据库(Protein Data Bank,简称)是全球权威的生物大分子三维结构数据存储平台,由Worldwide Protein Data Bank联盟统一监管。作为开放共享的公共资源,它要求科研人员将通过X射线晶体学、NMR光谱学等实验解析出的蛋白质、核酸及其复合物结构数据提交入库,目前已收录超19万条结构信息,其中蛋白质结构占比超90%。
PDB为每条结构分配唯一的四位字符ID,数据以标准PDB格式文件存储,包含原子坐标、二级结构信息、文献引用等关键内容。这些数据不仅支撑着基础生物学研究,比如揭示蛋白质结构与功能的关系,还在药物研发、蛋白质设计等应用领域发挥着关键作用——新冠疫情期间,科研人员正是通过PDB中的病毒蛋白结构数据,加速了疫苗和药物的研发进程。
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